历代医家通过大量的临床实践发现，六味地黄丸以滋补肾阴为主。从药方组成来看，它可以达到三阴同补，即补肾阴、补肝阴、补脾阴的效果。如熟地黄可以补肾阴;山茱萸则是肝肾同补，通过补肝来达到补肾的目的;山药能健脾益肾，通过健脾来补后天之本肾。由此可见，六味地黄丸只适用于阴虚，而不适用于阳虚。
肾阴虚的典型症状是潮热、盗汗、手心和脚心烦热、口燥咽干，此外还有遗精、梦遗、早泄等。所以，六味地黄丸只适用于具有这些症状的人群使用。肾阳虚的典型症状是腰膝酸软，不耐疲劳，经常乏力，四肢发凉，喜热怕冷等。有些肾阳不足的人，也可能会出现勃起功能障碍、早泄、滑精等性功能障碍。具有这些症状的人不适于六味地黄丸的滋补。
另外，还有几种人不宜服用六味地黄丸。如健康人群，如果没有明显肾阴虚的症状，不应该自行长期服用六味地黄丸;明显阳虚(包括肾阳虚、脾阳虚)的人不宜服用，否则病症就会“雪上加霜”;肾阴虚但脾胃功能不好的人，应当配伍服用六味地黄丸。六味地黄丸偏于补阴，配方中阴柔滋腻的药多一些，服后会妨碍消化功能。中老年人一般脾胃功能欠佳，要谨慎服用。
所以，服药六味地黄丸之前需经中医师把脉辨证，确认是肾阴虚还是肾阳虚，该不该服用，服多长时间，尽量避免由于盲目用药而造成的身体不适。
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