银屑病的转录组学研究进展

　　基因组学主要包括功能基因组学和结构基因组学。转录组学则是功能基因组学中的重要部分，是指在整体水平研究某一个细胞中基因的全部转录本在种类、结构、功能、和转录调控方面规律的科学。近年来已有越来越多的研究在转录组水平上探索其病理生理机制，用于转录组学研究的方法主要是基因芯片技术、第二代测序技术。银屑病是一种多基因遗传相关的炎症性皮肤病，银屑病转录组学的研究也随着转录组学的研究方法发展而不断进步。

　　一、基因芯片技术

　　基因芯片技术因其高效、简易等优势而被广泛应用，应用的是核苷酸原位杂交技术，将核苷酸通过各种技术手段按顺序排列、固定于固体载体上，形成DNA分子点阵，与处理好的样品进行杂交，从而获得所测样品的基因数量和序列信息。

　　有研究采用基因芯片技术比较正常皮肤与银屑病患者皮损、非皮损组织的miRNA表达。结果发现，14个差异表达的miRNA，正常皮肤与银屑病非皮损组织比较，存在表达差异的有11个；正常皮肤与银屑病皮损组织比较，存在表达差异的有12个。研究发现，银屑病皮损表皮中miR-21表达量较正常皮肤高出2.8倍，银屑病皮损真皮中其表达量较正常皮肤高出2.6倍，并通过抑制miR-21表达导致活化T细胞凋亡的比率增加，从而得出miR-21可以抑制活化T细胞的凋亡，其过度表达可能是导致T细胞介导银屑病的发生。

　　有作者通过定量RT-PCR得到miR-31主要在角质形成细胞、成纤维细胞、黑素细胞中表达，他们运用基因芯片对正常皮肤、银屑病皮损和非皮损的miR-31表达进行比较。正常皮肤中miR-31低表达，且仅限于基底层细胞，相反，在银屑病非皮损中较高表达，且在基底层和基底层以上细胞均出现，银屑病皮损中表达更高，且主要出现在基底层以上细胞。

　　二、第二代测序技术

　　与基因芯片技术相比，转录组测序技术（RNA-seq）可以检测发现新序列，无需设计已知探针；灵敏度高，可以检测低丰度目标序列，并可以检测重复序列，数字化信号使其用于较高的精确度，更广泛的动态变化范围，能够同时检测、定量正常和稀有转录本。

　　有研究通过RNA-seq技术比较了银屑病、扁平苔藓、特应性皮炎患者与健康人外周血T细胞的基因表达差异。在银屑病组中发现上调表达基因131个，下调20个，经过RT-PCR验证，在银屑病组中CD244和KLRC2下调表达，RPRD1B上调表达，与RNA-seq结果一致。虽然基因芯片技术是重要的技术手段，但只能发现部分差异表达基因，而RNA-seq能补充这些技术。

　　三、两种技术比较

　　在两种技术的研究中，发现了很多共同的差异表达基因。其中miR-21有较高的差异倍数。研究发现，miR-21负调控转录激活p63，在健康对照与未经治疗的银屑病患者样本分析中得到miR-21与转录激活p63呈正相关，与转录激活p63mRNA呈负相关，而转录激活p63是皮肤稳定的重要因子，与角质形成细胞的分化增殖密切相关，其可以直接结合且反式激活Dicer启动子，从而调控Dicer的转录，促进表皮的分化分层。

　　基因芯片技术相比，RNA-seq是一种更精确的转录组分析方法，其应用具有革命性意义。但是RNA-seq也具有其特殊的局限性：组织特异性，不同组织类型测得的序列是不统一的；时间独立性，在生命周期的不同时间测得的序列有所不同。转录组研究方法仍有待优化。

　　四、结语

　　虽然银屑病的确切病因尚不清楚，但普遍被认为是一种与基因、免疫、环境相关的复杂疾病。通过全基因组关联研究得知，很多基因已经被证实与银屑病的病因相关。整合了基因、环境和免疫因素的模型已经建成。近年来，银屑病的发病机制和治疗方面进展较快。随着转录组研究方法的不断进步，转录组水平上的研究也越来越多，不断发现新的转录本、差异表达基因，更好地了解银屑病的发病机制、遗传背景，为银屑病的治疗提供新的靶点。