长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的转录本,其突变和失调与广泛的人类疾病相关,其中与肿瘤的关系尤为密切,可通过致癌和抑癌两种途径在肿瘤中发挥潜在的作用。
一、lncRNA概述
基因表达的中心法则,即DNA转录为RNA,RNA再作为模板进行蛋白质合成。lncRNA的突变和失调与人类疾病相关,如肿瘤、心血管疾病、神经退行性病变疾病等。人类疾病相关lncRNA的发现,不仅有利于在lncRNA水平了解疾病的分子机制,而且有利于人类疾病的诊断、治疗、预后及防治的生物标记的识别。肿瘤相关lncRNA在各种人类肿瘤组织中频繁的异常表达。lncRNA可通过致癌和抑癌两种途径在肿瘤中发挥潜在作用。
二、黑素瘤相关的lncRNA
目前已发现几种lncRNA与人黑素瘤相关,它们在黑素瘤中表达异常,可通过增强细胞的运动性和侵袭性、抑制细胞凋亡等机制在黑素瘤的发生、发展及转移中发挥作用。
1、鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1(BRAF)基因激活的非编码RNA(BANCR):
BANCR在原发黑素瘤及转移样本中均过表达,BANCR可通过调节CXCL11的表达来调节体外黑素瘤细胞的迁移能力,研究证实了BANCR是黑素瘤细胞迁移的一个重要的调节因子,调节一组参与细胞迁移的基因,包括CXCL11。
2、HOX反义引物基因间RNA(HOTAIR):
HOTAIR是在2007年由Rinn等发现的一种lncRNA,长度为2.2kb,位于HOXC基因位点。与相邻的正常组织相比,HOTAIR在多种人类肿瘤中明显过表达,并可能具有促转移活性。有作者通过检测6种与肿瘤及转移相关的lncRNA在黑素瘤及转移淋巴结中的表达情况发现,HOTAIR在黑素瘤中的表达明显高于其他5种lncRNA,在淋巴结转移组织中的表达明显高于原发黑素瘤组织中的表达。
3、SPRY4内含子转录物1(SPRY4-IT1):
有作者通过研究证实,与黑素细胞相比,SPRY4-IT1在黑素瘤样本中的表达大幅增加,且SPRY4-IT1表达的下调显著抑制了黑素瘤细胞的生长。SPRY4-IT1的表达沉默导致了黑素瘤细胞的生长抑制、迁移和侵袭力下降,以及凋亡率增加。同时还发现,黑素瘤细胞过表达SPRY4-IT1时,细胞迁移的速度反而升高。
4、Llme23:
学者通过RNA-SELEX亲和层析法,在人黑素瘤细胞系的核RNA中筛选出一种结合PSF的lncRNA,命名为Llme23。目前,Llme23的表达仅在人黑素瘤中检测到。
5、INK4位点的反义非编码RNA(ANRIL):
ANRIL是细胞周期中重要的负性调控因子,其表达的下调与多种肿瘤的发展相关,包括黑素瘤。黑素瘤的高风险变异体rs1011970-T与ANRIL的表达降低相关。
6、结直肠肿瘤差异性表达(CRNDE):
CRNDE是在2011年发现的一种lncRNA。在葡萄膜黑素瘤中,SF3B1基因的突变与CRNDE外显子4内隐藏的选择性剪接有关,有助于明确CRNDE的选择性剪接对影响细胞功能的重要性。
7、尿路上皮癌相关基因1(UCA1)和肺腺癌转移相关转录子1(Malat-1):
UCA1和Malat-1表达水平的差异可用来评估黑素瘤细胞的迁移能力,UCA1和Malat-1的高表达可能与黑素瘤转移有关。UCA1和Malat-1表达的水平可能成为评估黑素瘤淋巴结转移的预后指标。
三、结语
越来越多的证据表明,lncRNA具有重要的生物学作用,lncRNA不仅在黑素瘤的致癌过程中发挥作用,同时,可能在黑素瘤的发生中起到抑制作用,如ANRIL。虽然目前对lncRNA的研究已取得令人瞩目的成果,但已发现的lncRNA数量有限,绝大部分的功能尚未明确,与黑素瘤相关的lncRNA更是少之又少,其在黑素瘤发生、发展及转移中发挥作用的分子机制亦不清楚,尚待进一步研究。
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