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种系变异对乳腺癌所致死亡的影响

摘要:对6万4171例雌激素受体阳性、1万6172雌激素受体阴性乳腺癌患者(其中乳腺癌所致死亡分别为4116例、2125例)进行雌激素受体相关性分析。利用贝叶斯假发现概率(BFDP)对真阳性概率进行评估,预设P<5×10-8为显著相关。

种系又称胚系或生殖系,是能够繁殖后代的细胞总称,包括单倍体配子(精子、卵子)以及最终能分化成配子的原始生殖细胞。种系变异对乳腺癌所致死亡的影响尚存争议。

2019年2月21日,英国癌症研究基金会和英国《自然》旗下《英国癌症杂志》在线发表荷兰、英国、德国、澳大利亚、加拿大、美国、西班牙、俄罗斯、芬兰、瑞典、比利时、丹麦、意大利、挪威、沙特阿拉伯、法国、希腊、波兰、爱尔兰、以色列、葡萄牙、哥伦比亚、中国天津医科大学天津市肿瘤医院肿瘤研究所的全基因组关联研究报告,通过大型荟萃分析调查了种系变异与乳腺癌所致死亡之间的相关性。

该研究根据多因素比例风险回归模型,对12组大样本数据、9万6661例乳腺癌女性、7697例乳腺癌所致死亡、大约1040万个变异进行荟萃分析。对6万4171例雌激素受体阳性、1万6172雌激素受体阴性乳腺癌患者(其中乳腺癌所致死亡分别为4116例、2125例)进行雌激素受体相关性分析。利用贝叶斯假发现概率(BFDP)对真阳性概率进行评估,预设P<5×10-8为显著相关。

结果,未发现任何与乳腺癌所致死亡显著相关的种系变异。

对于雌激素受体阳性乳腺癌,与乳腺癌所致死亡相关性最高的种系变异为7号染色体rs4717568(BFDP:7%,P=1.28×10-7,风险比:0.88,95%置信区间:0.84~0.92),靠近AUTS2基因。

对于雌激素受体阴性乳腺癌,与乳腺癌所致死亡相关性最高的种系变异为7号染色体rs67918676(BFDP:11%,P=1.38×10-7,风险比:1.27,95%置信区间:1.16~1.39),位于基因间长链非编码RNA基因AC004009.3内,靠近HOXA基因簇。

因此,该研究结果表明,7号染色体BFDP<15%的种系变异靠近有生物学证据与乳腺癌结局相关的基因。不过,全基因组关联分析未发现与乳腺癌所致死亡显著相关的种系变异,无法为乳腺癌患者提供个体化基因预后信息。

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