乙肝病毒是慢乙肝发病的根源，抗病毒是慢乙肝治疗的基础。目前常用药物有两大类，一类是干扰素，一类是核苷类药物。综合国外权威指南的建议与临床实践的经验，将抗病毒治疗的终点确定为三个层次，HBsAg→HBsAb是第一个层次。
实现HBsAg→HBsAb困难重重
从某种意义上讲，慢性乙型肝炎目前还是一种不可治愈的疾病。至今为止，还没有任何一种药物或治疗方法能够很有把握的实现乙肝表面抗原的阴转或血清转换(HBsAg→HBsAb，在很大程度上意味着病毒的彻底清除)。揪其原因，HBsAg在乙肝病毒感染中起以下两种作用：
HBsAg是乙肝病毒的“外衣”
每个乙肝病毒只需要约100个HBsAg分子作为它的外膜蛋白，但是在乙肝病毒复制过程中产生HBsAg的量比病毒装配所需要的大约多出了10万～100万倍，有数百万HBsAg分子在血液中循环。
HBsAg保护乙肝病毒
HBsAg不仅只有做病毒“外衣”的作用，还会作用于人体免疫细胞，比如：作用于T细胞，使其失去杀伤HBV感染的肝细胞的能力；作用于B细胞，使其不能对乙肝病毒产生抗体。
也就是说，HBsAg的持续存在使HBV感染慢性化，而HBsAg水平越低，病毒在体内的根基越不牢靠，越容易被清除。
HBsAg有可能消失吗
由于肝细胞的生命周期大约为100天，每天约有1%的肝细胞凋亡，新的肝细胞再生。因此，如果持续使用抗病毒药物抑制乙肝病毒复制，每天约有1%的旧的肝细胞(包括整合了HBVDNA的肝细胞)逐渐凋亡，新的未被病毒感染的“干净”肝细胞不断再生。这种情况长期持续下去，HBsAg是有可能消失的。
至于，使用哪种抗病毒药物，不妨借鉴2017年欧洲肝病学会发布的《慢性HBV感染管理临床实践指南》：推荐核苷(酸)类药物治疗慢性乙型肝炎理想的治疗终点是“确证为HBsAg消失(有或无抗HBs血清转换)”。
HBsAg消失后不能无所事事
经过多年的非活动性慢性乙型肝炎状态(低病毒载量且没有肝损伤迹象)，最终可能有些患者会发生乙型肝炎表面抗原(HBsAg)的清除，甚至产生表面抗体(抗-HBs)。
但是，HBV患者仍需警惕，HBsAg消失了，乙肝病毒并没有消失，仍然有HBV病毒潜伏在个体的肝脏中。个体身体健康时，免疫系统可以抑制HBV病毒并预防病毒重新激活。
随着年龄增长或罹患其他疾病都可能削弱个体的免疫系统，从而导致HBV的重新激活。因此，即便个体清除了HBsAg，仍然需要保持警觉，并继续定期监测肝脏的健康。
至于清除HBsAg后，多久进行一次肝脏监测，据斯坦福大学胃肠病学和肝病学博士RobertGish称，一旦清除HBsAg，12个月后需要︰
检测所有的肝酶水平和肝脏功能
进行血小板计数检测和乙型肝炎血液检测
接受肝、脾超声成像。
上述检测结果作为个体新的"基线"，这样医生在监测个体的肝脏健康时有所参考。
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