两种的主要成分是一样的，因此，两者的功效好主治完全一致，方中药物是临床上常用的中药，治疗效果显著，有需要的患者可以选用。但是两者的剂型不一样，石淋通胶囊属于胶囊剂，需要吞服；而石淋通颗粒为颗粒剂，开水冲服，适合不利于吞服的患者。