新生儿咽下综合征症状轻者一般不需特殊治疗，呕吐量大者应注意让患儿侧卧，以免吸入，适当禁食，给予支持治疗，当吞入液体吐净后，1至2天自愈。呕吐重者可用1%碳酸氢钠溶液或生理盐水洗胃，并查血电解质、血糖、血气等，称体重，以维持内环境的稳定。一般治疗1～2次后即可痊愈。