新生儿脓疱病需要和下列疾病相鉴别：1、金葡菌性烫伤样皮肤综合征。起病急，有严重的全身症状，皮损主要是大水疱，尼氏征阳性、剥脱显著，不具有大脓疱损害。2、遗传性大疱性表皮松解症。水疱多发生在手、足部等易受外伤和摩擦的部位，大疱内容物澄清，常有家族史。