新生儿肝炎综合征病因：1、感染因素。由甲、乙肝病毒，单纯疱疹病毒，风疹病毒等引起，还有细菌感染所致的中毒性肝炎。还可能是弓形虫、梅毒螺旋体等引起。2、胆汁排泄障碍。由肝脏内外胆管发育不全、胆汁黏稠、肝脏或胆道肿物等引起。3、家族中遗传代谢性缺陷病。包括半乳糖血症、果糖不耐受症、糖原累积病等。