原发性腮腺淋巴瘤的发生与放射线有密切关系。早在20世纪60年代就有把涎腺肿瘤作为放疗后并发症的报道。另外，病毒感染以及经常暴露在烟雾、灰尘中和接触化学品可能也与该病的发生有关。低度恶性的边缘区B细胞性淋巴瘤和黏膜相关性淋巴瘤常常发生于良性的淋巴上皮性病变和肌上皮涎腺炎，而肌上皮涎腺炎通常与自身免疫病有关，无自身免疫病的病人则很少发生该病。因此，推测该病与腮腺炎症及免疫功能紊乱有关。