原发性腹膜癌发病原因不明，组织来源尚有争议。主要有两种学说：来源于胚胎性移路径上残留的卵巢组织恶变；腹膜上皮与卵巢上皮源于同一间胚叶，均来自胚胎体腔上皮、具有苗勒管分化趋向的潜能，称为第二苗勒系统，日后受到某种致癌刺激而成癌。