对小阴茎患者应长期随诊至成年，观察了解阴茎发育、性行为及生育能力。有作者报道激素治疗不规律或延迟的患儿成年后阴茎发育差，性行为异常(同性恋)，有的要求变性。Reily及Woodhouse报道一组病人经早期诊断、治疗，虽然成年后大部分阴茎长度仍低于正常值，但性行为正常，故应正确采用内分泌、心理治疗。对阴茎过小，无治疗可能的病人，早期作变性手术是最好的选择。