由于目前缺乏特效的抗病毒药物，尖锐湿疣的治疗一般采用综合治疗。做手术和口服药物一起治疗的，可用5%酞丁胺霜剂，或用0.25%疱疹净软膏，每日2次，外涂。无环鸟苷口服，每日5次，每次200mg，或用其软膏外用，α-干扰素每日注射300万单位,每周用药五天。或干扰素300万单位注入疣体基部，每周2次。连用2-3周，主要副作用为流感样综合症，这种方法复发几率很高。