一种基因融合检测算法SOAPfuse,在深圳华大基因开发成功。该算法提高了基因融合的检测效率,推动疾病尤其是肿瘤的研究,对临床分子分型和肿瘤新药的开发具有重要意义。
深圳华大基因26日向此间媒体介绍,该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点,采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略,对基因融合进行快速、精确的检测。
基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起,形成一个嵌合基因的现象。这种现象一般是由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的,它们在癌症的发生上扮演着重要的角色,并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在血液系统恶性肿瘤中被发现,其中以慢性粒细胞白血病中BCR-ABL基因融合最为经典。随着对基因融合的深入研究,科研人员发现,除血液系统肿瘤外,在实体瘤中也存在着基因融合现象。
传统基因融合研究方法具有通量低、操作复杂、不便于大规模样品筛查的缺点。新算法—SOAPfuse首先通过比对到基因组和转录本中双末端(pairend)关系的序列寻找候选的基因融合,然后采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略,在尽量保留真实融合的情况下过滤掉其中假阳性的基因融合。
模拟数据和真实验证数据的综合测评表明,SOAPfuse与其他方法相比具有更高的灵敏度和特异性,并且可以大大减少资源消耗。此外,该算法还具有融合断点预测和可视化功能。
用于防治各种原因引起的白细胞减少症,急性粒细胞减少症,尤其是对肿瘤化学和放射治疗以及苯中毒等引起的白细胞减少症。
健客价: ¥8.5益肺清化膏:益气养阴、清热解毒、化痰止咳。适用于气阴两虚所致气短、乏力、咳嗽、咯血、胸痛;晚期肺癌见上述证候者的辅助治疗。 鸦胆子油软胶囊:抗癌药。用于肺癌,肺癌脑转移,消化道肿瘤及肝癌的辅助治疗剂。
健客价: ¥5000苗医:布苯怡象,麦靓麦韦艿曲靳,怡窝雄访达用于放化疗引起的白细胞减少、精神不振。 中医:解毒散结,补气养血。用于中晚期癌症的辅助治疗以及癌症放化疗引起的白细胞减少症属气血两虚者。
健客价: ¥130解毒,消肿,止痛。用于中、晚期肿瘤,慢性乙型肝炎等症。
健客价: ¥178补硒药。适用于低硒的肿瘤、肝病、心脑血管疾病病人或其他低硒引起的疾病。
健客价: ¥39扶正祛邪,软坚散结。用于消化道恶性肿瘤,乳腺恶性肿瘤,肺恶性肿瘤见于气血瘀阻证者。
健客价: ¥205.5广谱抗肿瘤药,用于胃癌、食管癌、贲门癌、肠癌等消化道肿瘤的治疗,以及消化道盒呼吸道肿瘤围手术期化疗,术后复发转移的预防用药,并可用于抑制各种胃癌、食管癌、肠癌等的癌前病变。
健客价: ¥990补气养血,健脾益肾。适用于癌症应用放、化疗所致白细胞减少及因放、化疗引起的头晕头昏,倦怠乏力、消瘦、恶心呕吐等症。
健客价: ¥40补气养血、健脾益肾。适用于癌症应用放、化疗所致白细胞减少及因放、化疗引起的头晕头昏、倦怠乏力、消瘦、恶心呕吐等症。
健客价: ¥50活血化瘀,消肿止痛。用于肺、肝、胃等多种癌症引起的疼痛。
健客价: ¥42补气养血,健脾益肾。适用于癌症应用放、化疗所致白细胞减少及因放、化疗引起的头晕头昏,倦怠乏力、消瘦、恶心呕吐等症。
健客价: ¥55活血化瘀,消肿止痛。用于肺、肝、胃等多种癌症引起的疼痛。
健客价: ¥79心血管疾病,如病毒性心肌炎、慢性心功能不全;肝炎,如病毒性肝炎、亚急性肝坏死、慢性活动性肝炎;癌症的综合治疗,能减轻放疗、化疗等引起的某些不良反应。
健客价: ¥15解毒,消肿,止痛。用于中、晚期肿瘤,慢性乙型肝炎等症。
健客价: ¥175补五脏虚劳;抗衰老;抑制肿瘤。
健客价: ¥98补五脏虚劳;抗衰老;抑制肿瘤。
健客价: ¥134补五脏虚劳;抗衰老;抑制肿瘤。
健客价: ¥210补五脏虚劳;抗衰老;抑制肿瘤。
健客价: ¥580用于治疗各种原因引起的白细胞减少症,如放射性、抗肿瘤药物等所致的白细胞减少症。
健客价: ¥32本品为非甾体抗炎药,且有镇痛,解热作用,用于风湿性或类风湿性关节炎,肿瘤止痛及肿瘤血液病退热。
健客价: ¥5.8关爱精英是一款针对中青年的常规体检套餐,在健康筛查的基础上针对血脂、肝功能、肿瘤标记物等检查项目进行了细化,特别关注高血脂、肝病等慢性病及常见肿瘤的筛查。
健客价: ¥606本品用于下列疾病的辅助治疗: 1.心血管疾病,如:病毒性心肌炎、慢性心功能不全。 2.肝炎,如:病毒性肝炎、亚急性肝坏死、慢性活动性肝炎。 3.癌症的综合治疗:能减轻放疗、化疗等引起的某些不良反应。
健客价: ¥331.心血管疾病,如病毒性心肌炎、慢性心功能不全;2.肝炎,如病毒性肝炎、亚急性肝坏死、慢性活动性肝炎;3.癌症的综合治疗,能减轻放疗、化疗等引起的某些不良反应。
健客价: ¥16清热解毒、消肿散结。用于肺炎、阑尾炎、蜂窝组织炎属热毒壅盛证侯者,并可用于癌症辅助治疗。
健客价: ¥18